Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr5Q9JLF7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms