Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gde1Q9JL56 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gde1Q9JL56 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gde1Q9JL56 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gde1Q9JL56 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gde1Q9JL56 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gde1Q9JL56 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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