Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms