Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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