Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nectin1Q9JKF6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nectin1Q9JKF6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nectin1Q9JKF6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nectin1Q9JKF6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nectin1Q9JKF6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nectin1Q9JKF6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nectin1Q9JKF6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nectin1Q9JKF6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nectin1Q9JKF6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nectin1Q9JKF6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nectin1Q9JKF6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nectin1Q9JKF6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nectin1Q9JKF6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nectin1Q9JKF6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nectin1Q9JKF6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nectin1Q9JKF6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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