Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms