Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms