Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms