Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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