Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tspan4Q9DCK3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Tspan4Q9DCK3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Tspan4Q9DCK3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Tspan4Q9DCK3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Tspan4Q9DCK3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tspan4Q9DCK3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tspan4Q9DCK3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tspan4Q9DCK3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Tspan4Q9DCK3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Tspan4Q9DCK3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Tspan4Q9DCK3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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