Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Hmg20aQ9DC33 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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