Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syde1Q9DBZ9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms