Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf580Q9DB38 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Znf580Q9DB38 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Znf580Q9DB38 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Znf580Q9DB38 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Znf580Q9DB38 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Znf580Q9DB38 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf580Q9DB38 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf580Q9DB38 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf580Q9DB38 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf580Q9DB38 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf580Q9DB38 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Znf580Q9DB38 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Znf580Q9DB38 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Znf580Q9DB38 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Znf580Q9DB38 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms