Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrmuQ9DAT5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms