Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgm5Q9D7I9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgm5Q9D7I9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgm5Q9D7I9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm5Q9D7I9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms