Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms