Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PrameQ9D4Z5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PrameQ9D4Z5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PrameQ9D4Z5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrameQ9D4Z5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms