Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc6Q9D4E6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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