Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Trappc6bQ9D289 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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