Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms