Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hddc3Q9D114 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms