Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NkapQ9D0F4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms