Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc47Q9D024 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc47Q9D024 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc47Q9D024 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc47Q9D024 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc47Q9D024 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc47Q9D024 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc47Q9D024 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc47Q9D024 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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