Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ61

Gm17509, Predicted gene, 17509, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17509Q9CZ61 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm17509Q9CZ61 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17509Q9CZ61 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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