Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gins3Q9CY94 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms