Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ddx28Q9CWT6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ddx28Q9CWT6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ddx28Q9CWT6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ddx28Q9CWT6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ddx28Q9CWT6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ddx28Q9CWT6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ddx28Q9CWT6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ddx28Q9CWT6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ddx28Q9CWT6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ddx28Q9CWT6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ddx28Q9CWT6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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