Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Cnot11Q9CWN7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Cnot11Q9CWN7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Cnot11Q9CWN7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Cnot11Q9CWN7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Cnot11Q9CWN7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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