Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms