Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MINDY3Q9CV28 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MINDY3Q9CV28 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms