Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2Q9CUU3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms