Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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