Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms