Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms