Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms