Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms