Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms