Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms