Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms