Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmd6Q99JI4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms