Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Smim11aQ99J19 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Smim11aQ99J19 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Smim11aQ99J19 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Smim11aQ99J19 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Smim11aQ99J19 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Smim11aQ99J19 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Smim11aQ99J19 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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