Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbox1Q924Y0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms