Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb6Q922F4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms