Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Afg3l1Q920A7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Afg3l1Q920A7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Afg3l1Q920A7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Afg3l1Q920A7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Afg3l1Q920A7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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