Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp3Q91W36 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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