Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd3Q91W18 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms