Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col26a1Q91VF6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms