Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms