Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms