Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms