Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trip10Q8CJ53 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trip10Q8CJ53 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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